Do zalet protokołu POP3 należy możliwość dostępu do poczty e-mail w trybie offline, ponieważ wiadomości są pobierane na urządzenie lokalne. Zmniejsza to wymagania dotyczące pamięci masowej serwera i ułatwia lokalne tworzenie kopii zapasowych wiadomości e-mail.
Do zalet protokołu POP3 należy prostota jego wdrożenia i użytkowania oraz zazwyczaj wymaga on mniej miejsca na serwerze, ponieważ wiadomości e-mail są usuwane z serwera po pobraniu.
Zalety protokołu POP obejmują dostęp w trybie offline i zmniejszone zapotrzebowanie na pamięć masową serwera. Do zalet protokołu IMAP należy synchronizacja na wielu urządzeniach i możliwość zarządzania wiadomościami e-mail bezpośrednio na serwerze.
Funkcje protokołu POP3 obejmują pobieranie wiadomości e-mail na urządzenie lokalne, usuwanie wiadomości e-mail z serwera po pobraniu oraz obsługę prostego i bezpośredniego dostępu do poczty e-mail bez konieczności ciągłego połączenia z serwerem.
Jedną z zalet protokołu poczty e-mail IMAP w porównaniu z protokołem poczty e-mail POP3 jest możliwość synchronizowania poczty e-mail na wielu urządzeniach, dzięki czemu zmiany wprowadzone na jednym urządzeniu zostaną odzwierciedlone na wszystkich innych podłączonych do tego samego konta e-mail.