WPA3 heeft bepaalde nadelen die in sommige gevallen van invloed kunnen zijn op de acceptatie en implementatie ervan. Een nadeel zijn compatibiliteitsproblemen met oudere apparaten die WPA3 mogelijk niet ondersteunen, waardoor upgrades of vervangingen nodig zijn om volledige netwerkbeveiliging te garanderen. Bovendien bracht de initiële uitrol van WPA3 een aantal interoperabiliteitsproblemen met bestaande netwerkapparatuur en -apparaten met zich mee, die integratiehindernissen zouden kunnen opleveren voor gebruikers en organisaties die overstappen van WPA2 naar WPA3.
De beperkingen van WPA3 hebben voornamelijk betrekking op de gefaseerde implementatie en apparaatcompatibiliteit. Hoewel WPA3 sterkere beveiligingsfuncties en bescherming tegen verschillende aanvallen biedt vergeleken met WPA2, is de acceptatie ervan geleidelijk verlopen vanwege de behoefte aan hardware- en software-updates op Wi-Fi-routers en clientapparaten. Deze gefaseerde aanpak kan de onmiddellijke beschikbaarheid en ondersteuning van WPA3 in alle netwerkomgevingen en gebruikersapparaten beperken, waardoor een grootschalige implementatie mogelijk wordt vertraagd.
De acceptatie van WPA3 is vanwege verschillende factoren trager verlopen in vergelijking met eerdere Wi-Fi-beveiligingsprotocollen. Eén reden is de geleidelijke overgangsperiode die nodig is voor fabrikanten om WPA3-ondersteuning in hun producten op te nemen en voor gebruikers om hun bestaande apparaten te upgraden. Bovendien hebben de uitdagingen op het gebied van complexiteit en interoperabiliteit die gepaard gaan met de implementatie van nieuwe beveiligingsstandaarden in diverse netwerkomgevingen bijgedragen aan de tragere adoptie van WPA3 op de consumenten- en zakelijke markten.
Zoals elk beveiligingsprotocol is WPA3 niet zonder gebreken. Hoewel het veel kwetsbaarheden in WPA2 aanpakt, kunnen er in de loop van de tijd nieuwe beveiligingszwakheden of implementatieproblemen ontstaan als aanvallers nieuwe methoden ontwikkelen om netwerkkwetsbaarheden te misbruiken. Problemen zoals configuratiefouten, firmware-bugs of ontoereikende beveiligingspraktijken door gebruikers en beheerders kunnen ook de effectiviteit van WPA3 ondermijnen bij het beschermen van Wi-Fi-netwerken tegen ongeoorloofde toegang of datalekken.
WPA3 zelf vertraagt niet inherent de internetsnelheid. De primaire functie van WPA3 is het verbeteren van de Wi-Fi-beveiliging door middel van sterkere encryptie- en authenticatiemechanismen, die onder normale bedrijfsomstandigheden geen significante invloed zouden moeten hebben op de internetprestaties. De algehele snelheid en prestaties van een Wi-Fi-netwerk kunnen echter worden beïnvloed door factoren zoals netwerkcongestie, signaalinterferentie, hardwaremogelijkheden en het aantal aangesloten apparaten, en niet alleen door de keuze van het beveiligingsprotocol.